在分子生物学和医学研究领域，福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本被视为宝贵的生物资源，包含了大量历史样本和临床信息。然而，FFPE样本在固定和存储过程中存在DNA降解、交联和片段化等问题，这些都成为了二代测序（NGS）分析的技术瓶颈。如何从FFPE样本中提取合格的DNA以建立高质量文库，已成为当前测序研究领域亟待解决的关键问题。

什么是FFPE样本

FFPE样本是指经过福尔马林固定石蜡包埋（Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded）技术处理和保存的生物组织样本。这种技术能够长期保存组织标本，便于运输，因而被广泛应用于病理学、组织学以及分子生物学研究，特别是在癌症和遗传学研究中，它是研究历史样本和临床样本的重要来源。

FFPE样本的应用

福尔马林固定能够有效地保存组织的结构和细胞的形态，而石蜡包埋则稳定了样本，为长期存储提供了良好的条件。这些样本具有很高的存档价值和临床应用潜力，允许研究人员进行跨越数年的回顾性研究。因此，FFPE样本成为连接临床病理数据与分子水平研究的重要桥梁，尤其适合那些需要从大量历史临床样本中提取基因组信息的研究项目。

FFPE样本的特点

FFPE组织切片被誉为生物医学研究中的“瑰宝”，它们富含疾病信息，能够为临床诊断和科学研究提供重要的支持。然而，制作FFPE样本的过程中既赋予了样本许多优势，也带来了相应的挑战。

高质量建库，修复是关键

从FFPE样本中提取临床材料是一种常见的且有效的方法。然而，固定和保存过程可能损害样本中的核酸质量，影响其完整性。因此，想要从样本获取高质量的序列数据，尤其在样本总量有限时，变得尤为困难。南宫28推出的FFPE修复试剂（HieffNGS® FFPEDNARepairReagent，Cat#12606ES）由多种酶按照特定配方优化混合而成，经过验证后证明能够有效修复FFPE样本中的DNA。这款修复试剂不仅提高了文库的产量，还具备无偏嗜性，整体提升了建库的成功率。

在文库构建过程中，我们进行了对比实验。实验组在末端修复加A步骤中添加了修复试剂，而对照组则未添加。结果显示，FFPE修复试剂显著提高了低质量FFPE样本的文库产出，而对高质量FFPE样本的影响则不明显。

修复试剂的稳定性测试

我们在4℃和25℃进行修复试剂的稳定性测试，结果显示在这两种温度下放置4周后，文库产量与对照组相比并未出现明显下降。

FFPE样本承载着大量宝贵的临床和科研数据。通过使用南宫28的FFPE样本修复试剂，研究人员能够最大限度地挖掘这些样本的潜力，将“沉睡”的数据转化为推动医学进步的重要资源。无论您是专注于肿瘤基因组研究、遗传学分析，还是历史样本解读，南宫28的FFPE修复试剂都能为您的研究提供强有力的支持。一起加入我们，让每一份样本都闪耀它的价值！

产品选择指南

产品名称：MolPure® MagneticFFPEDNAKit （磁珠法石蜡包埋组织DNA提取试剂盒）
产品编号：V218375ES
产品应用：FFPEDNA提取

产品名称：HieffNGS® FFPEDNARepairReagent （FFPE DNA样本修复试剂）
产品编号：12606ES
产品应用：FFPE DNA修复

产品名称：HieffNGS® DNALibraryPrepKit （全能型DNA建库试剂盒）
产品编号：2012927ES
产品应用：机械法建库

产品名称：HieffNGS® OnePotProDNALibraryPrepKit V3 （一步法DNA建库试剂盒）
产品编号：V312194ES
产品应用：酶切法建库